ในที่สุดจีโนมอ้อยที่มีความซับซ้อนสูงได้รับการจัดลำดับแล้ว

ในที่สุดจีโนมอ้อยที่มีความซับซ้อนสูงได้รับการจัดลำดับแล้ว

CIRAD และหุ้นส่วนของบริษัท* ต้องใช้ไหวพริบในการจัดทำลำดับอ้างอิงอ้อยชุดแรก จีโนมของพืชมีความซับซ้อนมากจนเทคนิคการหาลำดับแบบธรรมดาได้พิสูจน์แล้วว่าไร้ประโยชน์ ซึ่งหมายความว่าอ้อยเป็นพืชหลักสุดท้ายที่มีการจัดลำดับจีโนม วิธีการเรียงลำดับใหม่ ทีมงานใช้ถุงมือโดยใช้วิธีการที่ดีจากการค้นพบที่ CIRAD เมื่อ 20 ปีก่อน: โครงสร้างจีโนมของอ้อยและข้าวฟ่างมีความคล้ายคลึงกันมาก คำที่ใช้สำหรับสิ่งนี้คือ “colinearity” 

ซึ่งหมายความว่ามีความเท่าเทียมกันโดยมียีนจำนวนมากเกิดขึ้นในลำดับเดียวกัน 

Olivier Garsmeur นักวิจัยของ CIRAD และหัวหน้าทีมวิจัยจึงสามารถใช้จีโนมของข้าวฟ่างเป็นแม่แบบในการรวบรวมและเลือกชิ้นส่วนโครโมโซมของอ้อยตามลำดับ Angélique D’Hont นักพันธุศาสตร์ CIRAD ผู้ประสานงานการศึกษากล่าวว่า “ด้วยวิธีการใหม่นี้ ลำดับอ้างอิงที่ได้รับจากพันธุ์ Réunion, R570 จึงมีคุณภาพดีมาก” ขั้นตอนสำคัญในการตรวจสอบจีโนม ลำดับอ้างอิงนั้นเป็นขั้นตอนสำคัญในการจัดลำดับจีโนมอ้อยอย่างเต็มที่และวิเคราะห์ความผันแปรระหว่างพันธุ์อ้อยต่างๆ ได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น Angélique D’Hont มีประสบการณ์เดียวกันกับจีโนมของกล้วยในปี 2012 อย่างที่เธอกล่าวว่า “การมีลำดับอ้างอิงสำหรับสปีชีส์หนึ่งๆ จะเปลี่ยนวิธีการเกี่ยวกับจีโนมและพันธุกรรมในวงกว้างสำหรับสปีชีส์นั้นอย่างสิ้นเชิง”

ยุคใหม่ของการปลูกอ้อย เช่นเดียวกับพืชไร่อื่นๆ ก่อนหน้านี้ การปลูกอ้อยจะสามารถเข้าสู่ยุคของอณูชีววิทยาได้ จนถึงขณะนี้ สำหรับความต้องการลำดับอ้างอิง โครงการปรับปรุงพันธุ์อ้อยถูกจำกัดไว้เฉพาะการผสมพันธุ์ ตามด้วยการประเมินภาคสนามทั่วไปที่ยุ่งยากมาก ขณะนี้สามารถพัฒนาเทคนิคการคัดกรองระดับโมเลกุลเพื่อเสริมการทดลองภาคสนามได้ นี่เป็นความก้าวหน้าครั้งสำคัญ เนื่องจากเกือบ 80% ของน้ำตาลทั่วโลกมาจากอ้อย นอกจากนี้ โรงงานแห่งนี้ยังเพิ่งกลายเป็นผู้นำในการแข่งขันเพื่อผลิตชีวมวลอีกด้วย ความรู้ทางพันธุกรรมใหม่นี้จะช่วยสร้างความหลากหลายใหม่สำหรับการใช้งานที่หลากหลาย

จีโนมของอ้อยมีความซับซ้อนด้วยเหตุผลหลายประการ:

polyploidy สูง (สำเนาจำนวนมากของโครโมโซมแต่ละประเภท)

aneuploidy (จำนวนสำเนาขึ้นอยู่กับประเภทของโครโมโซม)

ต้นกำเนิดแบบคู่ของโครโมโซม

ความแตกต่างของโครงสร้างและโครโมโซมรีคอมบิแนนท์ระหว่างความจำเพาะ

* Joint Genome Institute, Keygene, Queensland Alliance for Agriculture and Food Innovation, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation, South African Sugarcane Research Institute, Universidade de S ã o Paulo ซึ่งได้รับทุนจาก International Consortium for Sugarcane Biotechnology และ Joint BioEnergy Institute

ความกตัญญู ต่อไป ผู้เข้าร่วมเน้นในการนำเสนอถึงความสำคัญของการจัดการคนและแสดงความขอบคุณเกษตรกรที่ทำ IPM ได้ดี ‘IPM เกี่ยวกับการเติบโตของพืชผลน้อยกว่าเกี่ยวกับการปล่อยให้คนเติบโต’ นอกจากนี้ จำนวนคนที่ทำงานด้านการเกษตรในเนเธอร์แลนด์จำนวนน้อยและยังคงลดลง ซึ่งปัจจุบันไม่ถึง 2 เปอร์เซ็นต์ของประชากรที่ทำงานทั้งหมดถือเป็นความเสี่ยง ‘นี่ไม่ใช่สถานการณ์ที่ยั่งยืนสำหรับการผลิตอาหาร’

โดยรวมแล้วหลักสูตรนี้ยังให้ความหวังแก่ผู้เข้าร่วมอีกด้วย เนื่องจากระบบของชาวดัตช์มีการเปลี่ยนแปลงและพัฒนาตลอดหลายปีที่ผ่านมา จึงต้องมีวิธีที่จะเปลี่ยนระบบที่บ้านให้ดีขึ้นได้เช่นกัน ผู้เข้าร่วมชาวแอฟริกันคนหนึ่งให้ความเห็น

Credit : hospitalitylawcheckin.com iawmontreal.org corsaworkshop.com awesomeology.org partyclips.net slimawayplan.com bawdrip.info endlessinnovationblog.com equivatexacomsds.com nitehawkvision.com